Intérêt du séquençage génomique haut débit « long-read pour le diagnostic causal des ataxies cérébelleuses
ALICA
CHU Dijon Bourgogne
THOMAS Quentin
Centre Hospitalier Universitaire Dijon Bourgogne
Patients
Inclusions en cours
À propos
Vous avez été adressé(e) au service de génétique ou de neurologie de votre centre hospitalier pour le suivi de votre ataxie cérébelleuse. Les ataxies cérébelleuses sont un ensemble de maladies neurologiques génétiques rares responsables de troubles de l’équilibre, de l’articulation ou encore de la coordination. Il est estimé que cette pathologie touche environ 26 individus pour 100 000 habitants. Ces dernières années, la génétique a connu un véritable bouleversement technologique avec le développement du séquençage « haut débit » permettant d’obtenir un diagnostic moléculaire chez de plus en plus de patients atteints d’ataxie cérébelleuse. Afin de trouver la cause génétique de votre pathologie, vous avez bénéficié d’un examen appelé « séquençage de génome en courts-fragments (short-read sequencing en anglais) ». Cet examen a permis de lire votre ADN sous forme de petits fragments et s’est avéré non concluant. Cette technique a ses limites puisque près de 40% des patients, comme vous, restent sans diagnostic moléculaire suite à cette analyse. Une nouvelle technique appelée « séquençage du génome en longs-fragments (long-read sequencing en anglais) » a récemment été développée. Elle repose sur la lecture de l’ADN sous forme de grands fragments et permettrait de détecter des anomalies génétiques non visualisables via le séquençage en courts-fragments dont vous avez bénéficié. Cette technologie reste cependant très récente et son intérêt pour le diagnostic de patients en errance reste à prouver. Au travers de ce projet, nous souhaitons évaluer la place du séquençage haut débit en longs-fragments dans le diagnostic des ataxies cérébelleuses et son potentiel à augmenter le rendement diagnostic des patients sans diagnostic malgré un génome en courts-fragments. Pour cela, nous avons besoin d’inclure des personnes atteintes d’ataxie cérébelleuse, mais également 1 à 2 de leur proche (parent ou fratrie) pour aider à l’analyse des résultats du séquençage haut débit en longs-fragments. C’est pourquoi, nous vous proposons aujourd’hui de participer à cette étude afin d’essayer de trouver la cause génétique de votre maladie. Si vous acceptez de participer à cette étude, vous serez sollicité(e) à 3 reprises : - Lors d’une visite d’inclusion ; - Lors d’une visite de rendu des résultats (environ 6 mois après la visite d’inclusion) ; - Lors d’une visite de fin d’étude (18 mois après la visite d’inclusion). Cette étude nationale se déroulera dans une dizaine de centres cliniques de France auprès de 70 patients et de leurs apparentés. Votre participation à cette étude sera d’une durée de 18 mois maximum.
Établissement(s) recruteur(s)
AP-HP - Hôpital La Pitié-Salpêtrière
Adresse :47 boulevard de l'Hôpital
75651 PARIS CEDEX13
France