Vers un flacon d’hémoculture intelligent : identification précoce in-situ des pathogènes responsables de bactériémie par profilage électrochimique couplé à un apprentissage machine (E-MOC)

À propos

Contexte et justification de la recherche / Pourquoi cette recherche est-elle mise en place ? En cas d’infection liée à la présence de bactéries pathogènes dans le sang, le traitement antibiotique mis en place au départ peut parfois ne pas être efficace. Il doit être réadapté le plus rapidement possible en fonction de l’identification de l’agent pathogène présent dans le sang et de ses résistances au(x) traitement(s). L’adaptation de ce traitement permet de réduire la mortalité chez les patients atteints. Le choix du traitement antibiotique approprié repose sur les résultats de culture bactérienne de prélèvements sanguins (hémoculture), dont le délai d’obtention des résultats reste trop important à ce jour. Ce projet vise à créer une base de données d’identification bactérienne par détermination du profil électrochimique de bactéries directement au sein du flacon d’hémoculture couplé à de l’intelligence artificielle (apprentissage machine) permettant potentiellement d’accélérer le diagnostic de cette infection et l’identification de la bactérie pathogène. Présentation de la recherche / En quoi la recherche consiste-t-elle ? Dans ce contexte, ce projet de recherche vise : 1/ à constituer une base de données de profils électrochimiques de bactéries en croissance au sein de flacons d’hémoculture, permettant une identification bactérienne rapide grâce à des outils d’intelligence artificielle ; 2/ à déterminer les performances d’identification bactérienne de ce nouveau test diagnostique ; 3/ de comparer les profils électrochimiques obtenus à partir de flacon d’hémocultures de patients potentiellement infectés et de donneurs sains. Pour cela nous avons besoin de collecter 2 à 4 flacons de sang supplémentaires (en une jusqu’à deux collectes) lors d’une ponction réalisée dans le cadre de la prise en charge de la pathologie pour laquelle vous avez été amené à consulter ou à être hospitalisé. Le volume de sang prélevé sera de 10 mL par flacon. Ainsi les volumes des prélèvements supplémentaires liés à la recherche ne dépasseront pas 40mL au total (4 flacons de 10 mL). Au total, au maximum200 personnes adultes, ayant une indication de prélèvements d’hémoculture dans le cadre de leur prise en charge, participeront à cette étude au CHU de Grenoble ou à l’Hôpital Avicenne. Ce projet est financé par l’Agence Nationale pour la Recherche. Votre participation à l’étude ne présente aucun risque. Les traitements, produits, stratégies et modalités d’administration sont autorisés et utilisés conformément à la pratique habituelle. Les seules procédures supplémentaires en lien avec l’étude sont le prélèvement de 2 à 4 flacons de sang supplémentaires (en une jusqu’à deux collectes) pour les besoins de la recherche en plus des flacons d’hémocultures prélevés dans le cadre de votre prise en charge. Ces actes ou procédures ne sont pas de nature à perturber vos soins. Déroulement de la recherche / Comment la recherche se déroule-t-elle ? Vous serez inclus dans l’étude pour une durée de 48h maximum. Les seules procédures supplémentaires en lien avec l’étude sont le prélèvement de 2 à 4 flacons de sang supplémentaires (en une jusqu’à deux collectes) pour les besoins de la recherche en plus des flacons d’hémocultures prélevés dans le cadre de votre prise en charge