Définition de sous-phénotypes de pneumonie sur la base de la composition du microbiome respiratoire
Composition du microbiome respiratoire pour prédire les échecs des traitements microbiens et cliniques

À propos

La pneumonie est responsable de plus de 60 % de la consommation totale d'antibiotiques dans le monde. La résistance aux antimicrobiens augmente le risque d'une thérapie antimicrobienne inadéquate et d'un échec thérapeutique dans les pneumonies acquises dans la communauté (CAP) et dans les pneumonies acquises à l'hôpital (HAP). L'échec thérapeutique est associé à une durée d'hospitalisation plus longue et à une surmortalité chez les patients septiques. Des données récentes ont démontré que le microbiome est une source importante de gènes de résistance aux antibiotiques (appelés résistome) qui peuvent rapidement être diffusés entre les espèces au cours du traitement. Notre objectif est d'évaluer comment le résistome respiratoire et la diversité et la richesse du microbiome respiratoire peuvent expliquer l'émergence de la résistance bactérienne et l'échec thérapeutique. Cet essai est proposé aux patients adultes se présentant aux urgences pour une pneumonie acquise dans la communauté (CAP) et nécessitant une hospitalisation en service général (cohorte 1) ou en unité de soins intensifs (cohorte 2) ou contractant une pneumonie acquise à l'hôpital nécessitant une ventilation invasive (vHAP ou VAP) (cohorte 3). L’objectif principal de cette recherche est d’étudier la relation entre la composition du microbiome respiratoire au début du traitement et le délai de réponse au traitement antibiotique. La mesure d'intérêt pour le critère d'évaluation principal sera le temps écoulé jusqu'au succès clinique (résolution des symptômes) sans échec microbiologique ultérieur ou résistance aux antibiotiques au cours de la période d'observation qui durera 90 jours après l'inclusion.