L’observatoire du diagnostic : lutter contre l’errance et l’impasse diagnostique au sein de la filière AnDDI-Rares

Critère d'inclusion:

WP1 :

• Enfants ou patients adultes n'ayant pas obtenu de diagnostic après consultation pour une anomalie du développement (pouvant inclure des malformations isolées ou multiples, mineures ou majeures, une dysmorphie faciale associée ou non à des troubles des apprentissages et/ou une déficience intellectuelle). Ces patients ont eu une évaluation diagnostique sur les 2 semaines tirées au sort entre 2012 et 2022.
• Patients acceptant de reprendre une démarche diagnostique nécessitant de nouveaux prélèvements sanguins. Pour le séquençage du génome via les plateformes du Plan France Médecine Génomique, lorsqu'elles correspondent aux critères des préindications existantes, l'échantillon des parents sera proposé.
• Patients (majeures ou leurs parents) affiliés à l'assurance maladie ou bénéficiaires d'un tel système

WP2 :

Pour l'identification des patients éligibles à une réanalyse (Partie 1 Labo) :

• Patients, enfants ou adultes présentant des anomalies du développement avec ou sans troubles neurodéveloppementaux,
• Patients avec des variations sporadiques du nombre de copies (CNV) de signification inconnue de plus de 1 Mb obtenues depuis le début des analyses CGH array sur le territoire.
• La variation sporadique du nombre de copies (CNV) est restée de signification inconnue ou classée comme (probablement) bénigne après réanalyse* *réanalyse autre que celle réalisée dans le cadre de l'observatoire diagnostique

Pour la réanalyse, en plus des critères d'inclusion précédents (Partie 2 Clinique) :

• La variation sporadique du nombre de copies (CNV) est restée de signification inconnue ou classée comme (probablement) bénigne après réanalyse**
• Les patients et/ou leurs parents acceptent de reprendre les tests de diagnostic
• Patients (adultes ou leurs parents) affiliés à l'assurance maladie ou bénéficiaires d'un tel système ** Après réanalyse dans le cadre de l'observatoire du diagnostic

WP3 :

• Patients (enfants ou adultes) présentant un syndrome répondant aux critères de l'étude :
• Diagnostic clinique établi pour l'un des syndromes caractéristiques du pipeline AnDDI-Rares (liste susceptible d'être révisée à l'avenir) : syndrome de Noonan, syndrome de CHARGE, syndrome de Kabuki, syndrome de Cornelia de Lange, syndrome de Rubinstein-Taybi ;
• Gène(s) connu(s) mais le diagnostic moléculaire du patient est négatif.
• Les patients et leurs parents acceptent un nouvel échantillon de sang pour le séquençage du génome ± ARN et/ou la biopsie cutanée pour les conditions où la transcription génique n'est pas satisfaisante à partir de l'ARN extrait du sang ; ou accepter d'effectuer ces analyses à partir d'échantillons préalablement stockés ;
• Parents majeurs affiliés à l'assurance maladie ou bénéficiaires d'un tel système ;
• Consentement éclairé signé des deux parents biologiques et/ou du cas index s'ils sont majeurs ;
• Capacité des deux parents biologiques à comprendre correctement.

Critère d'exclusion:

WP1 :

• Patients sans anomalie du développement ;
• Patients ayant un diagnostic préalablement identifié lors des consultations sur les semaines tirées au sort entre 2012 et 2022.

WP3 :

• Diagnostic clinique peu probable ;
• Famille ne souhaitant pas poursuivre les investigations moléculaires ;
• Cas index ayant déjà bénéficié des investigations dans le cadre d'un autre projet de recherche.
• Les parents du cas index sont sous protection judiciaire ;
• Familles dont l'un des 2 titulaires de l'autorité parentale n'est pas un parent biologique